一、Openslide简介

  1. Openslide是一个python的包。

  2. Openslide包是用来打开并处理医学图片的，类似.ndpi或者.mrxs这种全扫描片，目前都是通过openslide来进行处理的。

二、openslide安装

  1. 不能直接pip，要先下载二进制文件；

  2. 把下载好的二进制文件解压到自己喜欢的目录（如果是Anaconda环境，需要解压到Anaconda的Library目录下）；

  3. 然后配置环境变量，在系统变量Path里新建如下两个路径；

    比如解压在D盘的根目录下，则新建的路径如下：

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    D:\openslide-win64-20171122\openslide-win64-20171122\bin
    D:\openslide-win64-20171122\openslide-win64-20171122\lib

  4. Pip安装Openslide包，直接使用以下指令

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    pip install openslide-python

  5. 这里我们需要到openslide的安装目录下，修改名为lowlevel.py的文件，添加如下代码：

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    import os
    os.environ['PATH'] = "#这里为openslide安装目录的bin目录" + ";" + os.environ['PATH']

    注意：这里的openslide安装目录并不是上文第二步中提到的解压目录，而是第四步中pip的安装目录。非Anaconda环境的目录在C:\Users\username\AppData\Roaming\Python\Python37\site-packages\openslide 下；Anaconda环境的目录在Anaconda安装目录的.\envs\envirname\Lib\site-packages\openslide。

    更新：这里如果用的是python3.8及以上的版本，以上代码需要更改，因为3.8以上版本的读取路径方式发生了修改。

  6. 至此，Openslide安装就完成了，import openslide成功！

    备注：如果第六步报错，删掉lowlevel.py里的from . import _convert之后再次尝试import openslide便可成功。